260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0186 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
159 aa  324  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.38 
 
 
157 aa  210  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62.18 
 
 
156 aa  200  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.26 
 
 
158 aa  194  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.33 
 
 
157 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  60.26 
 
 
157 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.08 
 
 
161 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.02 
 
 
152 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.1 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  53.64 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.3 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62 
 
 
163 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.23 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.75 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
152 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.32 
 
 
154 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  48.06 
 
 
158 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  42.58 
 
 
150 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
162 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.39 
 
 
150 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
150 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.48 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  53.15 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.52 
 
 
145 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.38 
 
 
152 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  53.15 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  44.52 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  44.52 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.33 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.14 
 
 
163 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.14 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 
145 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
145 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  41.03 
 
 
159 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  41.03 
 
 
159 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.04 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  52 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  49.25 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  43.61 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
160 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.38 
 
 
146 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.47 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.38 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.41 
 
 
159 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  39.87 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.24 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  44.3 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  45.64 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  46.98 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.01 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  44.6 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.78 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 
145 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
158 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.01 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.24 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  47.01 
 
 
149 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.6 
 
 
146 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.44 
 
 
151 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.96 
 
 
156 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  39.24 
 
 
159 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.97 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.86 
 
 
153 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  43.97 
 
 
167 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  46.72 
 
 
157 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
159 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.47 
 
 
145 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.61 
 
 
159 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  38.61 
 
 
159 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  39.74 
 
 
159 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.54 
 
 
155 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.87 
 
 
159 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.73 
 
 
153 aa  104  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.36 
 
 
159 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.15 
 
 
145 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.69 
 
 
152 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  39.33 
 
 
159 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
153 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  56.14 
 
 
168 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 
155 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  38.36 
 
 
145 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 
157 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.73 
 
 
146 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.15 
 
 
153 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  48 
 
 
144 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  50.46 
 
 
167 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 
150 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  40.58 
 
 
157 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.59 
 
 
152 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 
158 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  41.5 
 
 
158 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
158 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
158 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 
157 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  48.62 
 
 
163 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.14 
 
 
158 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  36.62 
 
 
147 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>