106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4794 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4794  putative voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 154 aa  308  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  25.17 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  34.07 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  38.46 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  40 
 
 		 430 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 268 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  27.21 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  27.61 
 
 		 257 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  26.47 
 
 		 244 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 251 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  22.39 
 
 		 253 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  43.86 
 
 		 280 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  27.06 
 
 		 255 aa  51.2  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  37.74 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  32.05 
 
 		 357 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  30.67 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  26.12 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  36.62 
 
 		 405 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  28.57 
 
 		 253 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  26.73 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  26.55 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  29.13 
 
 		 265 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  29.27 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  31.71 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  35.71 
 
 		 240 aa  47.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  23.01 
 
 		 274 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 260 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  23.01 
 
 		 274 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  23.01 
 
 		 274 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  32.43 
 
 		 260 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 260 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  24.31 
 
 		 273 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  23.01 
 
 		 274 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 241 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  29.92 
 
 		 302 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  34.21 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  30.39 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  24.26 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  36 
 
 		 331 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  34.33 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  24.49 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  24.44 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  24.58 
 
 		 428 aa  46.2  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  24 
 
 		 274 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  24 
 
 		 274 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  27.37 
 
 		 331 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  38 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  32.18 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  25.24 
 
 		 274 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  22.45 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  27.78 
 
 		 267 aa  44.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  23.89 
 
 		 274 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  28.24 
 
 		 316 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.33 
 
 		 274 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  23.08 
 
 		 274 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  33.33 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.03 
 
 		 325 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  24.47 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  31.03 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  30.38 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  41.03 
 
 		 351 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  30 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  28.24 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  41.03 
 
 		 351 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  41.03 
 
 		 351 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  41.03 
 
 		 351 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  27.45 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  29.06 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  30.77 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  30.77 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  36.73 
 
 		 419 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  42.86 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 344 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  39.53 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  30.68 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  30.38 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  30.38 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  26.96 
 
 		 328 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  26.42 
 
 		 517 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 288 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  33.8 
 
 		 509 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 330 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  27.34 
 
 		 438 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  29.41 
 
 		 330 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  27.34 
 
 		 408 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.85 
 
 		 337 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  43.59 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  33.7 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  26.62 
 
 		 351 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  34.62 
 
 		 345 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 350 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>