50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2598 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.93 
 
 		 137 aa  95.9  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  36.43 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  35.56 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  34.78 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  33.57 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  36.57 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  33.09 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  29.77 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  31.85 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  31.43 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  31.72 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  30.08 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  33.58 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.11 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  25.19 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  25.74 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  26.81 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  28.79 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  24.63 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  26.47 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  26.76 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  29.79 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  43.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 75 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  38.98 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  23.31 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  27.93 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  27.93 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  27.93 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  35.29 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  26.43 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  27.42 
 
 		 72 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>