More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1461 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  100 
 
 
454 aa  948    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 
447 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 
473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  45.25 
 
 
443 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  46.07 
 
 
446 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 
471 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  45.29 
 
 
472 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  45.29 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 
442 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  41.2 
 
 
473 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 
464 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  41.14 
 
 
466 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 
464 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  41.68 
 
 
479 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 
462 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 
499 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 
466 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
482 aa  346  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 
462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  38.41 
 
 
452 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
445 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
432 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 
431 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
433 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
425 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
435 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
432 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
437 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
436 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.57 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.34 
 
 
427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
430 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
427 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
440 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
428 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
435 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.96 
 
 
435 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
436 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.22 
 
 
426 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
426 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
436 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.22 
 
 
426 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.22 
 
 
426 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
428 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
430 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
426 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32 
 
 
426 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32 
 
 
426 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.93 
 
 
426 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
427 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.71 
 
 
426 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  30.96 
 
 
430 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
424 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
435 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.53 
 
 
427 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
431 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 
433 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
430 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
435 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.41 
 
 
437 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
427 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
428 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  30.72 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.75 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.2 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
424 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
425 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
427 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.78 
 
 
430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>