39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0734 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  49.14 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  50.43 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  49.57 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  38.18 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  37.1 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  37.1 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.58 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  35.65 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  34.98 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  40.33 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  34.72 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  35.65 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  38.2 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  32.73 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  30.67 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  31.78 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  29.03 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  27.52 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  26.07 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  27 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.55 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  27.83 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  28.33 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  24.62 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.65 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  28.65 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.6 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  28 
 
 		 639 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  26.56 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.49 
 
 		 359 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.49 
 
 		 359 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  23.97 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  22.77 
 
 		 375 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  22.77 
 
 		 378 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  24.71 
 
 		 510 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.44 
 
 		 359 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>