More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0723 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  62.55 
 
 		 244 aa  332  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  62.55 
 
 		 244 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  61.35 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  61.35 
 
 		 244 aa  322  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  61.35 
 
 		 244 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  60.56 
 
 		 244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  60.56 
 
 		 244 aa  318  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  60.56 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  60.56 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  60.56 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  60.16 
 
 		 244 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  60.16 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  58.17 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  58.17 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  58.17 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  58.17 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  55.78 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  51.39 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  51 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38.21 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  41.63 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  40.82 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40.82 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  43.35 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  38.68 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  37.45 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  37.45 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  36.12 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.9 
 
 		 303 aa  171  7.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.92 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.11 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  39.26 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 369 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.97 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.66 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  40.79 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.25 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.55 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  37.5 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  39.42 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  41.47 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  41.47 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  39.48 
 
 		 293 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  35.37 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  38.94 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.4 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 583 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  40 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.86 
 
 		 337 aa  161  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.79 
 
 		 339 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  33.88 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  37.71 
 
 		 292 aa  161  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 		 305 aa  161  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  38.52 
 
 		 339 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.66 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  36.41 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 312 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36 
 
 		 312 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 322 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  35.93 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 312 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  38.14 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.4 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.65 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.46 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  38.27 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.5 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  33.86 
 
 		 578 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  35.8 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>