243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0688 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0688  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 586 aa  1220    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03866  thiamine pyrophosphate-binding domain protein  50.09 
 
 		 600 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3635  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.66 
 
 		 603 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0171  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1376  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  47.19 
 
 		 610 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1025  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  48.38 
 
 		 605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.36 
 
 		 557 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  24.55 
 
 		 541 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  23.64 
 
 		 558 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.4 
 
 		 576 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  25.46 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  24.71 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  24.71 
 
 		 558 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  24.04 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  24.86 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  24.04 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  25 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  23.65 
 
 		 561 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.07 
 
 		 545 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  22.77 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.21 
 
 		 552 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.04 
 
 		 552 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  23.59 
 
 		 580 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  22.76 
 
 		 549 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  24.37 
 
 		 555 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  23.36 
 
 		 543 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  23.01 
 
 		 542 aa  93.6  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  24.57 
 
 		 560 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  23.33 
 
 		 556 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  23.95 
 
 		 543 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  23.17 
 
 		 556 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.37 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  21.63 
 
 		 555 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.34 
 
 		 546 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.34 
 
 		 546 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.69 
 
 		 547 aa  87.8  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 558 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.12 
 
 		 572 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  24.2 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  22.1 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  22.59 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  22.62 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  21.23 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  21.06 
 
 		 540 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  21 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  21 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  21 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  21.72 
 
 		 713 aa  77  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  21.38 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  22.31 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  22.31 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.71 
 
 		 553 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  20.73 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  20.73 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  20.9 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  21.78 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  20.9 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  20.73 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  20.73 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  20.9 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  23.43 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  23.43 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  21.26 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  23.43 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  21.61 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  23.44 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  20.67 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  21.68 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  20.67 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  20.47 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  23.26 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  20.47 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  26.64 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  19.23 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  19.57 
 
 		 550 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  20.15 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  23.26 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  19.79 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  19.57 
 
 		 550 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  20.46 
 
 		 547 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  20.46 
 
 		 547 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  20.64 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  20.64 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  20.64 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.01 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.35 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  20.51 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  20.46 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.18 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  21.12 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  20.14 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  20 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  22.83 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.6 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  19.93 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.47 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  22.05 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  22.34 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  21.68 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  18.62 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>