More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3850 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  69.19 
 
 		 547 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  69 
 
 		 547 aa  809    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  69 
 
 		 547 aa  809    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  70.38 
 
 		 547 aa  816    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  58.41 
 
 		 552 aa  685    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  79.12 
 
 		 546 aa  921    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  65.75 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  65.93 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  65.75 
 
 		 546 aa  767    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  69 
 
 		 547 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  66.85 
 
 		 546 aa  775    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  65.99 
 
 		 558 aa  761    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  66.67 
 
 		 546 aa  774    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  69 
 
 		 547 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  65.93 
 
 		 546 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  64.47 
 
 		 563 aa  752    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  68.45 
 
 		 547 aa  807    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  65.82 
 
 		 550 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  66.48 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  69 
 
 		 547 aa  809    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  64.84 
 
 		 548 aa  759    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  66.85 
 
 		 546 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  65.93 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  100 
 
 		 546 aa  1132    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  69 
 
 		 547 aa  810    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  65.64 
 
 		 550 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  69 
 
 		 547 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  66.48 
 
 		 546 aa  773    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  68.82 
 
 		 547 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  65.64 
 
 		 550 aa  763    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  66.85 
 
 		 546 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  65.93 
 
 		 550 aa  784    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  65.75 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  61.68 
 
 		 556 aa  723    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  57.4 
 
 		 547 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  65.75 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  65.93 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  65.75 
 
 		 546 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  55.88 
 
 		 552 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  56.64 
 
 		 548 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  54.96 
 
 		 551 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  55.43 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  56.01 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.5 
 
 		 550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  49.91 
 
 		 544 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  50.82 
 
 		 565 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  43.47 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  43.02 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  44.17 
 
 		 550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  44.17 
 
 		 550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  43.61 
 
 		 550 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  43.05 
 
 		 545 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  43.31 
 
 		 547 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  41.98 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  42.19 
 
 		 547 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.73 
 
 		 554 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.86 
 
 		 547 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  39.74 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  38.82 
 
 		 583 aa  362  1e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.01 
 
 		 526 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  36.45 
 
 		 547 aa  347  4e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  35.45 
 
 		 559 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  34.7 
 
 		 559 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  35.82 
 
 		 562 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  35.82 
 
 		 562 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  35.82 
 
 		 562 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  35.63 
 
 		 562 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  35.63 
 
 		 565 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  35.63 
 
 		 565 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  35.45 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  35.45 
 
 		 562 aa  319  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  35.26 
 
 		 562 aa  317  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  32.97 
 
 		 548 aa  317  5e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  36.48 
 
 		 559 aa  316  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  34.95 
 
 		 562 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  33.58 
 
 		 567 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  34.14 
 
 		 567 aa  311  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  33.09 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  33.4 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  33.46 
 
 		 559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  34.57 
 
 		 561 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 546 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  33.7 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  33.27 
 
 		 560 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  33.46 
 
 		 558 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  32.91 
 
 		 554 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.77 
 
 		 567 aa  279  8e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.63 
 
 		 587 aa  279  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  33.46 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  33.46 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.87 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.38 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.23 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.02 
 
 		 615 aa  274  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  32.86 
 
 		 587 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  32.85 
 
 		 560 aa  273  5.000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.33 
 
 		 566 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  32.86 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  32.6 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  31.79 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>