More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2155 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  87.36 
 
 
554 aa  990    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  100 
 
 
554 aa  1138    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  56.78 
 
 
565 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  56.41 
 
 
562 aa  650    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  60.18 
 
 
560 aa  682    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  56.41 
 
 
562 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  56.59 
 
 
565 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  56.41 
 
 
565 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  56.23 
 
 
562 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  56.41 
 
 
562 aa  651    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  56.41 
 
 
562 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  56.59 
 
 
562 aa  653    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  58.02 
 
 
554 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  60.69 
 
 
558 aa  692    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  87.36 
 
 
554 aa  990    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  56.78 
 
 
562 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  51.71 
 
 
560 aa  578  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  50.81 
 
 
559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0522  acetolactate synthase  52.15 
 
 
561 aa  568  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485583  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  46.78 
 
 
559 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  47.88 
 
 
559 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  46.62 
 
 
559 aa  529  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  49.64 
 
 
561 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  46.25 
 
 
559 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  47.89 
 
 
567 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  46.47 
 
 
559 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  46.03 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  44.32 
 
 
548 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  42.46 
 
 
553 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  35.19 
 
 
547 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  34.75 
 
 
545 aa  342  9e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.85 
 
 
547 aa  337  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  34.3 
 
 
550 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  34.38 
 
 
550 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  34.38 
 
 
550 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  34.87 
 
 
545 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  34.38 
 
 
544 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  34.74 
 
 
547 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  33.76 
 
 
547 aa  313  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.15 
 
 
554 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  31.46 
 
 
544 aa  300  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  33.52 
 
 
563 aa  299  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  31.62 
 
 
583 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  33.7 
 
 
547 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  33.7 
 
 
547 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  33.7 
 
 
547 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  33.7 
 
 
547 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.87 
 
 
547 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  32.28 
 
 
547 aa  295  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  33.39 
 
 
547 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  33.39 
 
 
547 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  32.91 
 
 
546 aa  293  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  32.84 
 
 
547 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  33.46 
 
 
547 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.58 
 
 
526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  30.56 
 
 
556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  32.36 
 
 
547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  31.69 
 
 
548 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  32.22 
 
 
546 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  31.81 
 
 
550 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  32.36 
 
 
547 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  31.81 
 
 
550 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  30.74 
 
 
552 aa  279  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  31.68 
 
 
550 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  31.32 
 
 
551 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  30.22 
 
 
558 aa  278  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  31.55 
 
 
546 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  31.55 
 
 
546 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  31.55 
 
 
546 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  31.55 
 
 
546 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  31.55 
 
 
546 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  31.16 
 
 
548 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  31.37 
 
 
546 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.67 
 
 
554 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  31.37 
 
 
546 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  30.85 
 
 
583 aa  273  5.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  29.6 
 
 
547 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.39 
 
 
546 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  29.91 
 
 
546 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  29.91 
 
 
546 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  29.91 
 
 
546 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  29.72 
 
 
546 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  29.72 
 
 
546 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  29.72 
 
 
546 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  29.72 
 
 
546 aa  270  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  29.91 
 
 
546 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.05 
 
 
554 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.3 
 
 
552 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  30.6 
 
 
550 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.76 
 
 
550 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32 
 
 
561 aa  261  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33370  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  30.66 
 
 
556 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  29.14 
 
 
565 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.73 
 
 
561 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.91 
 
 
546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.5 
 
 
553 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.36 
 
 
565 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.26 
 
 
555 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.73 
 
 
572 aa  249  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.73 
 
 
563 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>