More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000394 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  76.72 
 
 		 567 aa  932    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  59.26 
 
 		 561 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  58.52 
 
 		 559 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  61.3 
 
 		 559 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  61.97 
 
 		 559 aa  702    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  100 
 
 		 567 aa  1180    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  61.11 
 
 		 559 aa  688    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  60.44 
 
 		 559 aa  691    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  47.63 
 
 		 562 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  47.63 
 
 		 562 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  47.79 
 
 		 565 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  47.63 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  47.63 
 
 		 565 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  47.81 
 
 		 565 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  47.63 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  47.63 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  47.63 
 
 		 562 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  47.81 
 
 		 562 aa  528  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  47.89 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  46.9 
 
 		 558 aa  496  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  47.45 
 
 		 560 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  45.49 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  45.49 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  45.54 
 
 		 554 aa  474  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  42.96 
 
 		 553 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  42.86 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  43.14 
 
 		 560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  44.02 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0522  acetolactate synthase  44.75 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  36.04 
 
 		 547 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  36.53 
 
 		 545 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  36.55 
 
 		 545 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  34.63 
 
 		 550 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  34.63 
 
 		 550 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  35.62 
 
 		 550 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  34.79 
 
 		 547 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  34.3 
 
 		 547 aa  316  6e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  33.58 
 
 		 546 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  34.26 
 
 		 547 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  35.03 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  33.63 
 
 		 552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  33.89 
 
 		 547 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  33.89 
 
 		 547 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.64 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  33.7 
 
 		 547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  33.52 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  33.52 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  33.52 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  34.07 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  33.95 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  32.9 
 
 		 544 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  33.15 
 
 		 547 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.13 
 
 		 547 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  32.28 
 
 		 546 aa  296  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  34.32 
 
 		 547 aa  295  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  32.66 
 
 		 550 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  33.15 
 
 		 547 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  32.54 
 
 		 563 aa  290  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  30.88 
 
 		 556 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.21 
 
 		 550 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  32.66 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  32.29 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  31.26 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  31.26 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  31.26 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  33.52 
 
 		 558 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  34.5 
 
 		 548 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.17 
 
 		 546 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  30.62 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  31.44 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  30.51 
 
 		 546 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.29 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  30.51 
 
 		 546 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.32 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  31.14 
 
 		 550 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 546 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  32.61 
 
 		 565 aa  277  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  31.32 
 
 		 550 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  32.43 
 
 		 551 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.3 
 
 		 554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  30.98 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.49 
 
 		 526 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  31.71 
 
 		 583 aa  261  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.67 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.21 
 
 		 548 aa  233  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  30.78 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.28 
 
 		 570 aa  230  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  30.78 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.2 
 
 		 571 aa  229  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.75 
 
 		 571 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 		 586 aa  229  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  30.05 
 
 		 554 aa  228  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>