More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0836 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  100 
 
 
559 aa  1151    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  58.7 
 
 
567 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  65.3 
 
 
559 aa  748    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  80.32 
 
 
559 aa  932    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  61.11 
 
 
567 aa  688    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  94.63 
 
 
559 aa  1098    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  65.6 
 
 
561 aa  757    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  77.1 
 
 
559 aa  915    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  50.99 
 
 
565 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  50.99 
 
 
565 aa  565  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  50.81 
 
 
562 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  50.99 
 
 
562 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  50 
 
 
565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  50.81 
 
 
562 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  50.81 
 
 
562 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  50.81 
 
 
562 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  50.63 
 
 
562 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  50.63 
 
 
562 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  48.72 
 
 
560 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  47.51 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  47.51 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  47.6 
 
 
558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  46.62 
 
 
554 aa  515  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  47.52 
 
 
554 aa  495  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  46.31 
 
 
548 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  45.34 
 
 
560 aa  474  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  43.38 
 
 
553 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  43.72 
 
 
559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0522  acetolactate synthase  45.52 
 
 
561 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  37.75 
 
 
545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  35.68 
 
 
547 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  36.75 
 
 
550 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  36.75 
 
 
550 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  38.1 
 
 
545 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  37.25 
 
 
550 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.21 
 
 
547 aa  329  9e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  36.56 
 
 
547 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.7 
 
 
554 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  36.55 
 
 
547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  35.71 
 
 
548 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  34.37 
 
 
547 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  34.39 
 
 
547 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  34.2 
 
 
563 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  34.69 
 
 
547 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  34.5 
 
 
547 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  33.82 
 
 
547 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  33.27 
 
 
550 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  33.21 
 
 
546 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  33.21 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  33.21 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  33.21 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  33.21 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  33.02 
 
 
546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  33.58 
 
 
547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  33.58 
 
 
547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  33.76 
 
 
547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  33.76 
 
 
547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  33.58 
 
 
547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  33.09 
 
 
550 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  33.27 
 
 
547 aa  306  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  32.78 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  33.58 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  33.09 
 
 
550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  34.5 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  33.46 
 
 
546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  33.94 
 
 
547 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  32.35 
 
 
552 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  33.09 
 
 
546 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  32.91 
 
 
546 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  32.91 
 
 
546 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  33.09 
 
 
546 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  32.91 
 
 
546 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  33.09 
 
 
546 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  33.09 
 
 
546 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  32.96 
 
 
546 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  32.53 
 
 
544 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  31.78 
 
 
544 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  32.91 
 
 
550 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  32.18 
 
 
547 aa  287  2.9999999999999996e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  31.69 
 
 
556 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  33.27 
 
 
548 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.82 
 
 
546 aa  286  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  31.61 
 
 
558 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.66 
 
 
550 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.65 
 
 
554 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.66 
 
 
552 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  31.87 
 
 
565 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  33.33 
 
 
551 aa  280  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  33.09 
 
 
583 aa  266  7e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.87 
 
 
526 aa  263  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.45 
 
 
548 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.82 
 
 
548 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.82 
 
 
548 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.82 
 
 
548 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.82 
 
 
548 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30 
 
 
548 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.64 
 
 
548 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30 
 
 
548 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.53 
 
 
548 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.53 
 
 
548 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>