More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3840 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1072    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  40.41 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  38 
 
 		 545 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  39.15 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  39.15 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  38.46 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  37.66 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  37.78 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  36.75 
 
 		 547 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.62 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  37.29 
 
 		 547 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  37.29 
 
 		 583 aa  350  4e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  38.09 
 
 		 547 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  37.18 
 
 		 583 aa  333  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  39.18 
 
 		 547 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  37.9 
 
 		 547 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  37.9 
 
 		 547 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.17 
 
 		 547 aa  332  9e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  37.9 
 
 		 547 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  37.9 
 
 		 547 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  37.9 
 
 		 547 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  37.9 
 
 		 547 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.49 
 
 		 554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  37.9 
 
 		 547 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  37.38 
 
 		 548 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  35.49 
 
 		 563 aa  321  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  37.71 
 
 		 547 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  37.52 
 
 		 547 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  33.52 
 
 		 544 aa  319  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  33.46 
 
 		 547 aa  319  9e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  35.03 
 
 		 550 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  35.25 
 
 		 548 aa  317  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  35.02 
 
 		 552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.22 
 
 		 552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.34 
 
 		 554 aa  309  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  34.46 
 
 		 550 aa  309  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  34.27 
 
 		 550 aa  309  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  38.46 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  35.02 
 
 		 550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  35.42 
 
 		 546 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  35.42 
 
 		 546 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  35.42 
 
 		 546 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 550 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  36.52 
 
 		 556 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  35.8 
 
 		 546 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  35.8 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  35.61 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  35.8 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  35.8 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  35.61 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  35.61 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  35.8 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  35.42 
 
 		 546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  34.78 
 
 		 546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  35.04 
 
 		 546 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  34.47 
 
 		 546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  35.23 
 
 		 546 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.4 
 
 		 546 aa  303  7.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  35.04 
 
 		 546 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.86 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  35.78 
 
 		 558 aa  299  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  35.51 
 
 		 565 aa  294  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  33.64 
 
 		 548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.82 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  31.48 
 
 		 562 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  31.48 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  31.48 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  31.48 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  31.3 
 
 		 562 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  31.3 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  31.48 
 
 		 565 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  30.73 
 
 		 567 aa  260  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  30.15 
 
 		 560 aa  260  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  31.3 
 
 		 565 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  31.3 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  29.47 
 
 		 554 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  29.47 
 
 		 554 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  29.78 
 
 		 554 aa  257  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  35.37 
 
 		 553 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  29.83 
 
 		 558 aa  256  5e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  29.09 
 
 		 554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  31.11 
 
 		 565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  30.62 
 
 		 567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.68 
 
 		 554 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.11 
 
 		 555 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.64 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.58 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.02 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.42 
 
 		 559 aa  240  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  33.27 
 
 		 581 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  31.28 
 
 		 559 aa  239  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.77 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.37 
 
 		 569 aa  238  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.09 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0522  acetolactate synthase  30.25 
 
 		 561 aa  237  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  33.27 
 
 		 578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  29.95 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.81 
 
 		 618 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  29.47 
 
 		 560 aa  235  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  29.42 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>