More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2375 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  56.59 
 
 
547 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  56.41 
 
 
547 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  56.41 
 
 
547 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  100 
 
 
551 aa  1118    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  55.33 
 
 
547 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  58.23 
 
 
546 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  58.41 
 
 
546 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  73.68 
 
 
550 aa  823    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  60.96 
 
 
552 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  71.79 
 
 
546 aa  805    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  59.19 
 
 
550 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  58.41 
 
 
546 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  57.69 
 
 
547 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  72.99 
 
 
548 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  58.41 
 
 
546 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  78.75 
 
 
552 aa  889    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  58.23 
 
 
546 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  56.59 
 
 
547 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  58.23 
 
 
546 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  58.04 
 
 
546 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  56.59 
 
 
547 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  58.41 
 
 
546 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  56.78 
 
 
547 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  58.46 
 
 
550 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  80.98 
 
 
554 aa  917    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  58.04 
 
 
546 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  54.96 
 
 
546 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  66.31 
 
 
565 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  59.15 
 
 
556 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  58.41 
 
 
546 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  58.23 
 
 
546 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  57.33 
 
 
547 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  58.46 
 
 
550 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  58.41 
 
 
546 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  58.04 
 
 
546 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  56.41 
 
 
547 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  58.04 
 
 
546 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  57.86 
 
 
546 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  55.13 
 
 
547 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  56.25 
 
 
558 aa  622  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  57.67 
 
 
547 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  55.6 
 
 
548 aa  617  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  53.01 
 
 
550 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  55.1 
 
 
546 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  55.35 
 
 
563 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  46.67 
 
 
544 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  41.43 
 
 
545 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  41.45 
 
 
550 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  41.45 
 
 
550 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  41.76 
 
 
545 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  40.48 
 
 
550 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  39.05 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  39.67 
 
 
547 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  40.58 
 
 
547 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  39.78 
 
 
544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.26 
 
 
547 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  38.25 
 
 
583 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.55 
 
 
554 aa  362  9e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  35.63 
 
 
547 aa  348  2e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  36.21 
 
 
583 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.92 
 
 
526 aa  321  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.46 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  33.27 
 
 
562 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  33.39 
 
 
562 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  33.39 
 
 
562 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  33.39 
 
 
562 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  33.27 
 
 
565 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  34.19 
 
 
565 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  33.21 
 
 
562 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  33.7 
 
 
562 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  33.88 
 
 
565 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  33.52 
 
 
562 aa  306  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  35 
 
 
559 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  34.44 
 
 
559 aa  299  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  33.27 
 
 
548 aa  296  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  35.2 
 
 
553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  33.83 
 
 
559 aa  290  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  33.33 
 
 
559 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  31.64 
 
 
558 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  35.36 
 
 
559 aa  287  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  32.43 
 
 
567 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  33.03 
 
 
559 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  31.02 
 
 
554 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  31.02 
 
 
554 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  32.22 
 
 
560 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  31.32 
 
 
554 aa  279  9e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  32.84 
 
 
567 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  34.01 
 
 
561 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0522  acetolactate synthase  32.54 
 
 
561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  31.57 
 
 
554 aa  274  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  30.83 
 
 
560 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.17 
 
 
581 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.35 
 
 
581 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  31.44 
 
 
589 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  31.44 
 
 
589 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.55 
 
 
563 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.44 
 
 
555 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.73 
 
 
562 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.55 
 
 
563 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  32.18 
 
 
562 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>