229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2984 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 		 354 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  98.59 
 
 		 354 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  27.74 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  28.07 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  28.07 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  28.07 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  28.07 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  29.07 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  28.07 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  28.78 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  28.07 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  29.81 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  29.07 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  29.05 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  29.86 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  25.71 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  26.55 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  27.86 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  25.88 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  25.53 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  26.44 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  27.38 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  25.56 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  27.88 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  28.75 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  28.45 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  25.07 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  32.26 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  25.45 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  27.67 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  24.54 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  25.98 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.32 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.49 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  26.44 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  27.97 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  20.25 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  22.64 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  25.93 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  22.4 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  26.85 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.07 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 542 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  28.17 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  20.74 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  25.53 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.1 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.5 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.5 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.5 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.5 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.1 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.1 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.1 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.1 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.61 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.3 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.9 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  25.07 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.13 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.13 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  25.93 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  23.57 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  21.87 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  30.72 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.09 
 
 		 438 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  26.82 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.39 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.27 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.58 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  28.48 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  21.98 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  33.58 
 
 		 405 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1751  permease  28.66 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  18.97 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  23.53 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  26.74 
 
 		 418 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  20.93 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  24.19 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  23.84 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  27.94 
 
 		 386 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  24.1 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  20.69 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  22.49 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>