More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01150 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  100 
 
 		 748 aa  1548    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  47.52 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  47.1 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  63.29 
 
 		 292 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  61.69 
 
 		 300 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  54.12 
 
 		 299 aa  327  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26437  Spermidine synthase  51.89 
 
 		 319 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.047075 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  45.07 
 
 		 316 aa  263  8.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  45.26 
 
 		 275 aa  259  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  44.2 
 
 		 277 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  44 
 
 		 275 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  44.65 
 
 		 276 aa  231  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  41.73 
 
 		 277 aa  231  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  31.26 
 
 		 454 aa  226  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  42.86 
 
 		 281 aa  226  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  40.66 
 
 		 277 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  40.29 
 
 		 275 aa  224  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  33.91 
 
 		 934 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  41.4 
 
 		 279 aa  219  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  40.21 
 
 		 302 aa  217  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  45.05 
 
 		 275 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  44.69 
 
 		 275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  44.69 
 
 		 275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  44.69 
 
 		 275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  44.69 
 
 		 275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  44.69 
 
 		 275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  44.69 
 
 		 275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  44.69 
 
 		 275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  40.07 
 
 		 273 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  44.32 
 
 		 275 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  44.32 
 
 		 275 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  42.7 
 
 		 278 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  43.96 
 
 		 275 aa  212  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  44 
 
 		 275 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  40.7 
 
 		 295 aa  212  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  41.64 
 
 		 283 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  43.22 
 
 		 278 aa  206  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  38.57 
 
 		 283 aa  206  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  38.1 
 
 		 279 aa  204  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  37.45 
 
 		 286 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  37.5 
 
 		 286 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  37.5 
 
 		 286 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  43.46 
 
 		 280 aa  200  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  38.49 
 
 		 284 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  40.08 
 
 		 290 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  28.79 
 
 		 456 aa  199  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  40.08 
 
 		 291 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  36.06 
 
 		 286 aa  198  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  37.27 
 
 		 291 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.05 
 
 		 441 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  36.79 
 
 		 283 aa  197  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  38.08 
 
 		 285 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  38.13 
 
 		 296 aa  196  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  37.64 
 
 		 286 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  36.43 
 
 		 283 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  37.77 
 
 		 293 aa  196  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  37.59 
 
 		 289 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  36.9 
 
 		 279 aa  194  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  34.16 
 
 		 287 aa  194  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  37.88 
 
 		 293 aa  194  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  36.33 
 
 		 288 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  37.27 
 
 		 286 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  35.99 
 
 		 288 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  36.73 
 
 		 286 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  36.73 
 
 		 286 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  36.73 
 
 		 286 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  34.93 
 
 		 296 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  36.73 
 
 		 286 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  34.93 
 
 		 296 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  34.84 
 
 		 284 aa  190  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  36.36 
 
 		 286 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  34.93 
 
 		 296 aa  190  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  36.73 
 
 		 289 aa  189  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  35.14 
 
 		 287 aa  189  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  35.11 
 
 		 287 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  34.62 
 
 		 287 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  38.01 
 
 		 279 aa  187  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  37.06 
 
 		 283 aa  187  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  29.86 
 
 		 439 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  37.41 
 
 		 280 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  39.13 
 
 		 290 aa  187  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  37.37 
 
 		 283 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  38.95 
 
 		 271 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  36.67 
 
 		 280 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  36.3 
 
 		 280 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  36.52 
 
 		 287 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  35.48 
 
 		 307 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0073  spermidine synthase  35.21 
 
 		 286 aa  184  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  34.77 
 
 		 283 aa  183  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  37.79 
 
 		 283 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  37.45 
 
 		 296 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  36.05 
 
 		 278 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  36.69 
 
 		 316 aa  180  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>