More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00660 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  100 
 
 		 727 aa  1493    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  35.58 
 
 		 708 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  32.7 
 
 		 718 aa  347  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  31.88 
 
 		 753 aa  340  5e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  34.25 
 
 		 630 aa  339  9e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.5 
 
 		 720 aa  331  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  29.81 
 
 		 751 aa  308  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  31.56 
 
 		 678 aa  296  7e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.6 
 
 		 752 aa  282  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  31.93 
 
 		 667 aa  259  9e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  30.08 
 
 		 698 aa  233  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  31.44 
 
 		 706 aa  231  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  29.03 
 
 		 721 aa  224  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 607 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.83 
 
 		 610 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 610 aa  214  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 610 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 599 aa  210  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 602 aa  210  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 602 aa  210  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  29.88 
 
 		 699 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 		 606 aa  209  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.56 
 
 		 610 aa  209  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 660 aa  206  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  30.38 
 
 		 611 aa  205  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 605 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 615 aa  204  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 		 599 aa  203  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.09 
 
 		 597 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 602 aa  203  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 637 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 610 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 1162 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 593 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 649 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 611 aa  201  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.76 
 
 		 601 aa  201  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 599 aa  201  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 633 aa  201  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  27.32 
 
 		 679 aa  200  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 607 aa  200  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  28.5 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 595 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 617 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 616 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 620 aa  197  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 602 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 599 aa  195  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 601 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 599 aa  194  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 601 aa  194  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 663 aa  193  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 509 aa  193  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  27.47 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 602 aa  193  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 594 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 		 614 aa  191  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 605 aa  191  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 603 aa  190  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 606 aa  189  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 609 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.64 
 
 		 602 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 598 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 622 aa  189  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 616 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  29.34 
 
 		 597 aa  188  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 619 aa  188  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 601 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 		 606 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 1174 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 603 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 601 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 598 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0164  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 658 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 633 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 		 601 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 602 aa  183  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  27.21 
 
 		 600 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 604 aa  182  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  27.55 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  28.35 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 596 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 611 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 606 aa  181  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  29.41 
 
 		 580 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 		 601 aa  180  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  27.38 
 
 		 1174 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>