More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03350 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03350  multidrug resistance protein fnx1, putative  100 
 
 		 585 aa  1184    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01350  transporter, putative  41.22 
 
 		 582 aa  409  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671168  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06830  multidrug resistance protein fnx1, putative  36.02 
 
 		 534 aa  273  5.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02560  multidrug resistance protein fnx1, putative  32.97 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.777678  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03888  multidrug efflux transporter (Eurofung)  31.46 
 
 		 542 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  30.28 
 
 		 550 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00350  conserved hypothetical protein  38.3 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01766  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  33.64 
 
 		 636 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00201  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  28.94 
 
 		 652 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.27955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 569 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 483 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.21 
 
 		 504 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.24 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.49 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.75 
 
 		 539 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.58 
 
 		 685 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.47 
 
 		 535 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 		 505 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 		 682 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 		 682 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 		 682 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.64 
 
 		 535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58666  MFS transporter  31.82 
 
 		 398 aa  163  7e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 		 592 aa  163  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 		 498 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.11 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28802  MFS efflux transporter  26.69 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.211393  normal  0.613875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.84 
 
 		 555 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 685 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 621 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.15 
 
 		 680 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.95 
 
 		 678 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  26.12 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  26.12 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  28.17 
 
 		 537 aa  157  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  27.99 
 
 		 476 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 476 aa  156  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  27.78 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  27.78 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  27.78 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.08 
 
 		 697 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.49 
 
 		 650 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.05 
 
 		 1062 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.16 
 
 		 479 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.16 
 
 		 479 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.77 
 
 		 538 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.72 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.72 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.94 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03290  tetracycline efflux protein, putative  28.31 
 
 		 652 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0454964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.72 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.72 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 480 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 526 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 526 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 		 554 aa  150  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 528 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.85 
 
 		 567 aa  150  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50606  hypothetical protein  27.58 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  28.14 
 
 		 571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.17 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.03 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.65 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 		 565 aa  147  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.37 
 
 		 641 aa  146  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07112  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03920)  26.56 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_009068  PICST_37347  suppressor of gal11 null  24.74 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 525 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  28.97 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 		 523 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.15 
 
 		 562 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 666 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 		 522 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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BN001302  ANIA_04180  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08230)  25.39 
 
 		 561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.48 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.78 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
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NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 530 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.07 
 
 		 526 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
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NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 504 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.66 
 
 		 592 aa  140  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 504 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 		 491 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006680  CNK02830  multidrug transporter, putative  31.96 
 
 		 358 aa  140  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 		 557 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
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NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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