191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1544 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  94.37 
 
 
315 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  45 
 
 
324 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  35.21 
 
 
294 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  29.82 
 
 
333 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  30.26 
 
 
333 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  29.03 
 
 
359 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  30.88 
 
 
306 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  36.62 
 
 
373 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  31.94 
 
 
332 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  28.92 
 
 
307 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  30.88 
 
 
316 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  34.69 
 
 
356 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  35.21 
 
 
358 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  35.21 
 
 
358 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  29.67 
 
 
358 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  32.42 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  35.57 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  32.18 
 
 
345 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  32.18 
 
 
345 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  27.45 
 
 
304 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  32.18 
 
 
345 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  39.35 
 
 
300 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  33.79 
 
 
301 aa  104  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  26.76 
 
 
311 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  28.17 
 
 
293 aa  99.8  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  27.55 
 
 
318 aa  99  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  28.64 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  39.16 
 
 
294 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  27.7 
 
 
315 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  29.5 
 
 
319 aa  91.3  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  22.61 
 
 
348 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  27.7 
 
 
315 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  29.11 
 
 
323 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  24.63 
 
 
351 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  27.04 
 
 
296 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  25.13 
 
 
353 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  27.78 
 
 
323 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  29.47 
 
 
323 aa  85.1  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  21.5 
 
 
352 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  23.62 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  29.52 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  33.33 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  37.39 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  27.23 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  29.5 
 
 
336 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  33.58 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  33.58 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  36.52 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  23.3 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  24.62 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  31.28 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  22.56 
 
 
364 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  23.12 
 
 
348 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  24.12 
 
 
354 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  23.12 
 
 
366 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  24.48 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  28.28 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  24.62 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  24.88 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  22.61 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  31.43 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  20.69 
 
 
350 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  24.88 
 
 
356 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  33.33 
 
 
361 aa  79  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  23.44 
 
 
350 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  29.37 
 
 
337 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  29.81 
 
 
337 aa  78.2  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  24.88 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  27.08 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  27.67 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  21.36 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  27.08 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  27.83 
 
 
319 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  21.36 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  25.14 
 
 
332 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  20.69 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  18.78 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  22.93 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  22.61 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  25.64 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  26.43 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  35.64 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  22.92 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  20.2 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  22.07 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  20.69 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  21.61 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  28.08 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  21.2 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  27.18 
 
 
315 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  22.28 
 
 
331 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  21.28 
 
 
331 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  22.87 
 
 
331 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  23.74 
 
 
351 aa  71.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  21.08 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  22.83 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  21.43 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  27.61 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  27.27 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>