32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3251 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  100 
 
 
976 aa  1948    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  41.06 
 
 
953 aa  508  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  44.5 
 
 
2411 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  44.64 
 
 
2367 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  52.91 
 
 
2454 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  40.15 
 
 
2421 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  38.88 
 
 
1976 aa  298  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  34.09 
 
 
2807 aa  290  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  42.62 
 
 
4978 aa  202  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  27.28 
 
 
2418 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  26.9 
 
 
1259 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  26.83 
 
 
2772 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.42 
 
 
4896 aa  104  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  38.5 
 
 
1987 aa  102  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  34.02 
 
 
1223 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  36.88 
 
 
707 aa  85.5  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  27.11 
 
 
2416 aa  81.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  28.65 
 
 
1436 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  30.9 
 
 
673 aa  79  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  27.22 
 
 
4120 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  32.52 
 
 
4071 aa  58.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  39.83 
 
 
891 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  24.55 
 
 
1527 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  27.54 
 
 
1740 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  29.61 
 
 
1969 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.16 
 
 
2833 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  34.81 
 
 
1084 aa  48.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  30.05 
 
 
1243 aa  48.1  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  26.96 
 
 
2402 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  25.82 
 
 
1452 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  36.36 
 
 
1331 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  24.75 
 
 
4429 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>