36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3077 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  100 
 
 		 673 aa  1372    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  30.96 
 
 		 953 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  33.93 
 
 		 1223 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1976 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  30.18 
 
 		 976 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.04 
 
 		 1079 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  30.57 
 
 		 2454 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  34.23 
 
 		 2807 aa  67  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.27 
 
 		 2411 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.27 
 
 		 2367 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  29.94 
 
 		 4896 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  30.23 
 
 		 2421 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  27.15 
 
 		 915 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.33 
 
 		 1987 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  36.7 
 
 		 707 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  22.85 
 
 		 1527 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  28.52 
 
 		 2772 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  23.74 
 
 		 3793 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 		 1332 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.17 
 
 		 4978 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  25.52 
 
 		 2418 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  25.97 
 
 		 4120 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  42.47 
 
 		 2416 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.09 
 
 		 1657 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1259 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.92 
 
 		 1236 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  24.35 
 
 		 1217 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  24.62 
 
 		 1247 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  31.18 
 
 		 1108 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06765  hypothetical protein  27.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1059 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  26.88 
 
 		 750 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  24.5 
 
 		 1474 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1331 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  31.11 
 
 		 739 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01330  hypothetical protein  30.77 
 
 		 306 aa  44.3  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.719075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>