More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2986 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  100 
 
 		 263 aa  527  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  66.41 
 
 		 264 aa  349  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  61.83 
 
 		 262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  61.33 
 
 		 271 aa  332  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  62.81 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  50.2 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  49.17 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  41.56 
 
 		 269 aa  204  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  38.7 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  36.94 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  37.23 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  37.19 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  35.65 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  35.65 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  36.29 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  36.29 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  35.87 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  38.54 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  32.93 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  35.78 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  36.13 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  33.93 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  29.85 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  37.67 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  34.73 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  36.16 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.43 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  30.7 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  36.07 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.53 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  38.96 
 
 		 285 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  37.33 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  35.32 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.08 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  36.06 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  34.2 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  32.64 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  37.72 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.78 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  37.72 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  36.1 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  30.58 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  31.98 
 
 		 376 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  36.04 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.14 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.5 
 
 		 380 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  29.34 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  32.64 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  30.7 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  38.38 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  33.04 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  32.68 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  33.49 
 
 		 372 aa  131  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.63 
 
 		 328 aa  131  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  36.77 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  34.82 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.5 
 
 		 386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  34.48 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.62 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  35.78 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  33.03 
 
 		 368 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.75 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  36.28 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  33.77 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  36.41 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  36.32 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  30.51 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  35.27 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  35.45 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  37.02 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  30.7 
 
 		 393 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  34.91 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.76 
 
 		 376 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  32.52 
 
 		 413 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  30.32 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.62 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  34.42 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2908  hypothetical protein  34.11 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  30.67 
 
 		 364 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  33.17 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1817  toluene tolerance protein  36.15 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  33.05 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1749  hypothetical protein  36.15 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.627131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  35.82 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  34.19 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  32.48 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  30.9 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  34.19 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  34.19 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  34.19 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  35.55 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.06 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>