More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2203 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
180 aa  360  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  55.11 
 
 
196 aa  204  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  53.98 
 
 
195 aa  200  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  41.49 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  39.77 
 
 
192 aa  131  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  37.43 
 
 
187 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 
203 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 
232 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  35.59 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1659  cytochrome c oxidase, subunit III  37.58 
 
 
195 aa  94  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  32.75 
 
 
237 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  33.7 
 
 
229 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  33.33 
 
 
209 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  31.28 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  33.53 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  36.36 
 
 
288 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 
222 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 
215 aa  84  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  31.36 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  32.97 
 
 
832 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.77 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  31.43 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  32 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.32 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  31.43 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
291 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  28.73 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.29 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  29.38 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.29 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.29 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  30.29 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2069  cytochrome c oxidase, subunit III  32.4 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  26.46 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  34.75 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6008  cytochrome c oxidase, subunit III  32.4 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0674382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2105  cytochrome c oxidase, subunit III  32.4 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2088  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.4 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.98 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  30.36 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.81 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  32.87 
 
 
294 aa  74.7  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5374  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  32.4 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  34.07 
 
 
274 aa  74.3  0.0000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1211  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.84 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.34 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  28.49 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  28.35 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  29.61 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1975  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.4 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  29.29 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  31.67 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  27.43 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  29.26 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  30.6 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2716  ubiquinol oxidase, subunit III  29.38 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.089432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  33.08 
 
 
288 aa  71.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  31.69 
 
 
293 aa  71.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  31.08 
 
 
279 aa  71.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  34.08 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  32.56 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  33.6 
 
 
273 aa  71.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1635  CyoC  30.51 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00622543  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  32.56 
 
 
292 aa  71.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 
237 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2835  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.31 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
283 aa  71.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  28.42 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2774  ubiquinol oxidase, subunit III  29.38 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  31.67 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  29.38 
 
 
827 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  30.34 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  34.81 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  28.42 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  28.19 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  34.53 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  28.42 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  28.42 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  28.42 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  30.15 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  31.9 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.71 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  27.54 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  27.17 
 
 
819 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  32.33 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5011  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.51 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565569  normal  0.0682866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.47 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1786  cytochrome c oxidase subunit III  28.25 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  30.05 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  27.87 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  29.19 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  31.47 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.12 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  30.15 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  30.15 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  31.01 
 
 
292 aa  67.8  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  34.4 
 
 
284 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  33.07 
 
 
288 aa  67.8  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  32.33 
 
 
289 aa  67.8  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>