171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0879 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  31.78 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  33.47 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  34.39 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  29.7 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  30.98 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  36.48 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  30.34 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  30.42 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  33.49 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  32.86 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  27.16 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  29.52 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  27.49 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  23.89 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  28.41 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  28 
 
 		 384 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  24.89 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  26.37 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.29 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.29 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.29 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  23.9 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.29 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.29 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  25.5 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  24.31 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  26.49 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  23.16 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  28.25 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  24.45 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  23.81 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.29 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  31.73 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  29.66 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.16 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.16 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.56 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 431 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  31.88 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  29.1 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 393 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 191 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 391 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5485  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 384 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  39.33 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  26.88 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  24.76 
 
 		 189 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 423 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 423 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 383 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  29.85 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  25 
 
 		 391 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  25 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  26.46 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  29.38 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  27.78 
 
 		 362 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 391 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 385 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  27.81 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  24.18 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 387 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  26.58 
 
 		 185 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 415 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 185 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  24.27 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>