192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1634 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  69.93 
 
 
450 aa  672    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  100 
 
 
448 aa  925    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  66.07 
 
 
446 aa  628  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  64.81 
 
 
448 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  64.81 
 
 
448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  64.37 
 
 
448 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  61.02 
 
 
448 aa  569  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  58.97 
 
 
448 aa  567  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  58.71 
 
 
451 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  58.71 
 
 
498 aa  553  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  53.9 
 
 
446 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  48.78 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  45.7 
 
 
463 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 
447 aa  350  3e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  40.27 
 
 
446 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 
462 aa  332  9e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
470 aa  325  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.13 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  23.04 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  24.74 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 
547 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  24.84 
 
 
553 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  24.84 
 
 
553 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  24.03 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  26.22 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  24.41 
 
 
547 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  23.78 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  23.78 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  27.03 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  23.78 
 
 
548 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04171  malate:quinone oxidoreductase  23.84 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129432  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  22.64 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  23.57 
 
 
548 aa  72.4  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  26.27 
 
 
492 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  23.99 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  26.27 
 
 
492 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  23.99 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  23.53 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2950  malate:quinone oxidoreductase  24.2 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  23.34 
 
 
527 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  23.99 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  26.04 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  23.28 
 
 
539 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  23.83 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.81 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  23.19 
 
 
625 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  23.99 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  23.06 
 
 
539 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  23.99 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  24.57 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  22.2 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  24.08 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  25.06 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  22.86 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  26.11 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  23.26 
 
 
521 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  22.94 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4438  malate:quinone oxidoreductase  22.59 
 
 
501 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  23.71 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  25.91 
 
 
488 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  23.35 
 
 
545 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  24.71 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2400  malate/quinone oxidoreductase  23.93 
 
 
489 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1524  malate:quinone oxidoreductase  24.14 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000801477  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3915  malate:quinone oxidoreductase  23.62 
 
 
545 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  25.27 
 
 
510 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  23.3 
 
 
553 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  25.38 
 
 
509 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  23.28 
 
 
498 aa  63.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  23.18 
 
 
545 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  23.13 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41330  malate:quinone oxidoreductase  22.57 
 
 
510 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0751  malate:quinone oxidoreductase  21.93 
 
 
502 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 
576 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0779  malate:quinone oxidoreductase  21.93 
 
 
502 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0792  malate:quinone oxidoreductase  21.93 
 
 
502 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1166  malate:quinone oxidoreductase  23.26 
 
 
565 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  23.48 
 
 
396 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1788  malate:quinone oxidoreductase  22.71 
 
 
550 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0152962  normal  0.0435205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1509  malate:quinone oxidoreductase  22.71 
 
 
568 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0613705  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  23.61 
 
 
402 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  22.74 
 
 
545 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  23.14 
 
 
549 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>