59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1155 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  100 
 
 
1677 aa  3271    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  30.03 
 
 
1068 aa  191  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  27.72 
 
 
998 aa  113  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.48 
 
 
1242 aa  112  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  24.48 
 
 
831 aa  106  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  26.22 
 
 
1886 aa  80.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 
1004 aa  75.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 
1033 aa  75.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  28.51 
 
 
10429 aa  74.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  23.25 
 
 
2848 aa  69.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.63 
 
 
759 aa  67  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  23.83 
 
 
1782 aa  66.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.39 
 
 
1001 aa  66.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  25.91 
 
 
990 aa  66.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.99 
 
 
763 aa  65.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  31.91 
 
 
646 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  31.91 
 
 
646 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  23.08 
 
 
1769 aa  58.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  27.64 
 
 
1012 aa  57.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  23.16 
 
 
1001 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.86 
 
 
1251 aa  57.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  28.87 
 
 
636 aa  57  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  26.09 
 
 
1121 aa  56.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  22.18 
 
 
995 aa  55.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  24.5 
 
 
1016 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  22.41 
 
 
983 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  23.03 
 
 
972 aa  54.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.99 
 
 
915 aa  53.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.76 
 
 
913 aa  53.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  23.83 
 
 
640 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  21.93 
 
 
1130 aa  50.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  23.81 
 
 
991 aa  50.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  28.48 
 
 
1175 aa  49.7  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 
728 aa  49.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  25.5 
 
 
728 aa  49.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  25.5 
 
 
728 aa  49.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  21.35 
 
 
991 aa  49.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  23.91 
 
 
1028 aa  48.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  22.22 
 
 
939 aa  48.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  23.66 
 
 
1011 aa  47.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  24.02 
 
 
407 aa  47.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  23.45 
 
 
3506 aa  48.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.61 
 
 
2302 aa  48.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 
629 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  23.13 
 
 
629 aa  47.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  21.43 
 
 
1066 aa  47.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  24.07 
 
 
650 aa  47  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  22.66 
 
 
629 aa  47  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  26.57 
 
 
1172 aa  46.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.03 
 
 
1842 aa  46.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  20.56 
 
 
909 aa  45.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.03 
 
 
1865 aa  46.2  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.15 
 
 
1358 aa  45.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0311  hypothetical protein  24.86 
 
 
2342 aa  45.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  24.65 
 
 
640 aa  45.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.3 
 
 
1048 aa  45.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  23.04 
 
 
1025 aa  45.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.19 
 
 
1369 aa  45.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1329  outer membrane autotransporter  21.71 
 
 
1058 aa  45.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0892684  normal  0.563685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>