More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0740 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  89.58 
 
 		 355 aa  659    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  721    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  81.43 
 
 		 355 aa  597  1e-169  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  80 
 
 		 355 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  78.03 
 
 		 355 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  78.03 
 
 		 355 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  79.44 
 
 		 355 aa  566  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  77.46 
 
 		 355 aa  564  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  70.7 
 
 		 355 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  68.45 
 
 		 355 aa  511  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  60.6 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  58 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  58 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 		 363 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  55.77 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  58 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  56.16 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 363 aa  391  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  56.77 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  56.77 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  56.77 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  56.77 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 362 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  56.77 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  56.03 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>