More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0677 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  55.8 
 
 
141 aa  161  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  42.42 
 
 
143 aa  107  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  43.08 
 
 
133 aa  106  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  37.14 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  33.87 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  50.85 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  28.57 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  60.87 
 
 
191 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  42.67 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  51.85 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  51.85 
 
 
187 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  41.54 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  37.12 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  55.81 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  31.53 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  67.65 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  38.89 
 
 
191 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  41.54 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0706  hypothetical protein  23.36 
 
 
145 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.769661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  45.28 
 
 
178 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  75.86 
 
 
231 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  42.59 
 
 
197 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  32.58 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  26.98 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  37.31 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  46.67 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  42.31 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  35.06 
 
 
185 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  45.76 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  30.59 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  34.31 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  43.4 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  45.1 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  32.58 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  32.28 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  30.37 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  38.46 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  38.46 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  38.46 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  56.76 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  38.71 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  29.7 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  35.53 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  72.41 
 
 
132 aa  48.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  41.79 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  41.67 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  38.46 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  51.28 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  37.5 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  45.28 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  29.77 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  31.53 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  36.62 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  31.53 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  38.46 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  37.88 
 
 
229 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  36.92 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.53 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  61.76 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  34.85 
 
 
212 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  39.06 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  38.1 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  38.1 
 
 
182 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  34.92 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  34.92 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  37.1 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  34.92 
 
 
169 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  40.68 
 
 
193 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  31.94 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  38.46 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  30.23 
 
 
150 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  28.81 
 
 
169 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  30.23 
 
 
150 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  30.23 
 
 
150 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  32.39 
 
 
130 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  41.94 
 
 
163 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  29.93 
 
 
169 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  38.33 
 
 
179 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  38.46 
 
 
173 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  44.44 
 
 
163 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  44.44 
 
 
163 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  36.92 
 
 
178 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  41.51 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  36.54 
 
 
180 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  37.74 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  35.38 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>