More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07826 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  41.86 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  42.06 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.35 
 
 
186 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  38.89 
 
 
229 aa  170  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
228 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  43.46 
 
 
210 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.51 
 
 
186 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  44.02 
 
 
262 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  43.43 
 
 
198 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 
211 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  43.65 
 
 
184 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.1 
 
 
182 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  41.44 
 
 
225 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  42.05 
 
 
182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  42.61 
 
 
178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  42.13 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  41.01 
 
 
181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  39.9 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  42.22 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
245 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  43.1 
 
 
190 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.57 
 
 
301 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  40.29 
 
 
225 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  39.89 
 
 
242 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.57 
 
 
301 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  41.62 
 
 
186 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  41.95 
 
 
184 aa  158  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.61 
 
 
301 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  41.08 
 
 
185 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 
236 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  42.37 
 
 
246 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  39.05 
 
 
176 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  43.65 
 
 
240 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  43.65 
 
 
238 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  43.09 
 
 
240 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.96 
 
 
302 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.86 
 
 
301 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  39.29 
 
 
236 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.4 
 
 
301 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.4 
 
 
301 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  42.51 
 
 
180 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  43.1 
 
 
246 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1656  peptide methionine sulfoxide reductase  40.65 
 
 
225 aa  154  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  42.53 
 
 
209 aa  154  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  41.95 
 
 
180 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  40.94 
 
 
178 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  42.44 
 
 
175 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  41.81 
 
 
248 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  37.44 
 
 
235 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
177 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  39.67 
 
 
246 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  38.73 
 
 
183 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.86 
 
 
301 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  38.14 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  39.89 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  48.98 
 
 
368 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.25 
 
 
301 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0267  peptide methionine sulfoxide reductase  43.26 
 
 
197 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  39.08 
 
 
178 aa  151  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  40.66 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.67 
 
 
301 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  39.13 
 
 
246 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  40.68 
 
 
225 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  40.68 
 
 
246 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  40 
 
 
397 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.14 
 
 
287 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  41.04 
 
 
235 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  39.66 
 
 
186 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  43.26 
 
 
181 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  37.9 
 
 
233 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  41.42 
 
 
176 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  37.06 
 
 
179 aa  148  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
173 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  39.68 
 
 
234 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  37.71 
 
 
175 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  39.66 
 
 
178 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  39.31 
 
 
182 aa  148  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  37.08 
 
 
180 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.77 
 
 
301 aa  147  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  38.2 
 
 
179 aa  147  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  41.27 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  40.8 
 
 
179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  39.33 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  37.29 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  38.55 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  41.42 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  39.43 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  38.55 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  37.36 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  38.55 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  38.59 
 
 
247 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  39.11 
 
 
199 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  36.52 
 
 
181 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
334 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  40.11 
 
 
204 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  36.52 
 
 
181 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  37.75 
 
 
247 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  36.65 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  40.22 
 
 
182 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>