More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04395 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  39.04 
 
 
258 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  31.68 
 
 
262 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
279 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
265 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 
270 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  31.58 
 
 
270 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
247 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
270 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  31.34 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  31.58 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  30.19 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  31.2 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  31.2 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  31.2 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.34 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.44 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.32 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 
239 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.86 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  29.7 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.69 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.69 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.34 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.76 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.29 
 
 
371 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.52 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  34.51 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  29.85 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  24.8 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  24.8 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.86 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  23.32 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  24.44 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.05 
 
 
368 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.82 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.23 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  24.32 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.05 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  23.02 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  30.26 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  24.41 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  24.41 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  24.63 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  31.53 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  25.4 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  35.65 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  24.59 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>