230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02940 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02940  polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
364 aa  725    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0870  a-glycosyltransferase  33.86 
 
 
361 aa  172  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.179475  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
400 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  28.43 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  19.5 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  22.39 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  21.17 
 
 
363 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  25.42 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
388 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 
382 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  27.21 
 
 
416 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.56 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 
429 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  21.49 
 
 
419 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5069  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
416 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0287  glycosyl transferase group 1  18.5 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1696  glycosyl transferase, group 1  20.36 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  20.78 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.37 
 
 
396 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 
368 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.12 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  19.45 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1207  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 
323 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  0.0214801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5853  putative glycosyl transferase  22.84 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0350572  normal  0.772659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  18.81 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  19.59 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  18.18 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
401 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
380 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  19.81 
 
 
413 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
412 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
854 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  22.09 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
404 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  25.49 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
753 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  19.81 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4251  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.170492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  20.7 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  31.54 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  22.4 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  18.69 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  22.7 
 
 
411 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
426 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
380 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  20.65 
 
 
403 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  26.95 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  20.65 
 
 
403 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
409 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  25.47 
 
 
390 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 
377 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  24 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.66 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
455 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  24.14 
 
 
419 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  23.28 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  21.08 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.7 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>