194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5853 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5853  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 410 aa  834    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0350572  normal  0.772659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1696  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 380 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2483  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0486018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0870  a-glycosyltransferase  22.33 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.179475  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02940  polysaccharide biosynthesis protein-like protein  18.84 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 768 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  31.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  30 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  30.56 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0287  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0110  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.38 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000484936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 360 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0336  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30.71 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2150  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  20.98 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  27.68 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 891 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  26.35 
 
 		 310 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  27.95 
 
 		 355 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 355 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.25 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 354 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  25.67 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.52 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 355 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3253  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 369 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0227534  normal  0.148006 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 354 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 354 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 354 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  20 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  27.97 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 854 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  29.55 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 822 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.17 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.52 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.92 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  25.45 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.52 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.52 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>