More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0484 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0484  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0256  transcriptional regulator, LysR family  87.63 
 
 		 322 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 304 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 307 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 307 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 307 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  45.6 
 
 		 322 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 307 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 307 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 307 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 296 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 296 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4819  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 300 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0036  transcriptional regulator, LysR family  40.78 
 
 		 306 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 301 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 302 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6844  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 309 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 293 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 298 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 298 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 299 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 300 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 296 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 296 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 296 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 296 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  37.84 
 
 		 312 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 302 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 302 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 299 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 296 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 302 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 299 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 299 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 298 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  40.78 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 306 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  40.78 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 299 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 302 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  34.05 
 
 		 304 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 296 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 304 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  36.67 
 
 		 304 aa  111  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 304 aa  111  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  41.34 
 
 		 297 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 295 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 323 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 296 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.87 
 
 		 296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 299 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  40.44 
 
 		 297 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 295 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 296 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  42.46 
 
 		 335 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 295 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 299 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 319 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 295 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 302 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 295 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  39.11 
 
 		 295 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  43.03 
 
 		 295 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  41.51 
 
 		 309 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 308 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 294 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 295 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 301 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 303 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 323 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 303 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 299 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  37.78 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 315 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 292 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 298 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 297 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 302 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 292 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 306 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 296 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>