159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1584 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  88.5 
 
 
200 aa  347  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  70.41 
 
 
205 aa  270  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  66.84 
 
 
200 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  66.32 
 
 
200 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  64.82 
 
 
205 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  64.82 
 
 
205 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  65.79 
 
 
200 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  65.79 
 
 
200 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  67.38 
 
 
200 aa  234  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  66.84 
 
 
205 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  66.84 
 
 
205 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  66.84 
 
 
205 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  66.84 
 
 
205 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  65.24 
 
 
200 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  66.84 
 
 
187 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  65.24 
 
 
205 aa  228  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  66.31 
 
 
200 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  61.46 
 
 
188 aa  225  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  59.9 
 
 
188 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  65.7 
 
 
190 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  57.22 
 
 
191 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  54.17 
 
 
194 aa  184  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  56.68 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  52.91 
 
 
209 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  55.98 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  56.82 
 
 
212 aa  174  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  54.45 
 
 
189 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  52.69 
 
 
172 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  55.17 
 
 
195 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  52 
 
 
190 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  51.43 
 
 
194 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  54.76 
 
 
195 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  47.4 
 
 
192 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  53.49 
 
 
194 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  47.34 
 
 
173 aa  151  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  50 
 
 
177 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  47.26 
 
 
195 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  38.75 
 
 
176 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  44.07 
 
 
183 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  42.74 
 
 
173 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  42.66 
 
 
177 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  46.67 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  45 
 
 
174 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
174 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  42.22 
 
 
175 aa  94.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
181 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
181 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 
181 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  44.96 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  38.51 
 
 
176 aa  89  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  35.8 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  40.52 
 
 
168 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  35.15 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  36.92 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  32.65 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  35.86 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  39.1 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  39.1 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  34.44 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  34.01 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28.72 
 
 
276 aa  68.2  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  36.69 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.39 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  34.81 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.03 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  28.67 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  35.43 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.03 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  32.7 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  27.97 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  26.11 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  26.11 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  34.35 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  34.46 
 
 
211 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  33.82 
 
 
358 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  32.82 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.3 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
319 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  31.16 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.42 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13353  methyltransferase  31.79 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.356592  normal  0.242787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2826  hypothetical protein  31.16 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.232142  normal  0.188578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  35.66 
 
 
259 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  43.33 
 
 
388 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  33.1 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
305 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.3 
 
 
258 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  27.41 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
212 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>