52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1184 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  62.5 
 
 		 983 aa  1184    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  44.14 
 
 		 1042 aa  854    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  95.01 
 
 		 963 aa  1852    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  96.23 
 
 		 955 aa  1900    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  79.87 
 
 		 962 aa  1523    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  80.4 
 
 		 962 aa  1534    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  68.38 
 
 		 889 aa  1213    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  80.29 
 
 		 962 aa  1540    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  63.85 
 
 		 913 aa  1183    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  79.1 
 
 		 978 aa  1490    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  63.74 
 
 		 913 aa  1181    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  52.11 
 
 		 948 aa  948    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  94.44 
 
 		 956 aa  1837    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  50.93 
 
 		 952 aa  922    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  51.21 
 
 		 954 aa  917    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  50.77 
 
 		 954 aa  915    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  94.21 
 
 		 969 aa  1829    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  64.26 
 
 		 973 aa  1231    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  67.2 
 
 		 1002 aa  1278    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  83.1 
 
 		 949 aa  1640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  52.32 
 
 		 941 aa  932    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  82.06 
 
 		 949 aa  1572    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  45.27 
 
 		 908 aa  833    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  81.63 
 
 		 960 aa  1569    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  65.23 
 
 		 917 aa  1213    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  95.4 
 
 		 659 aa  1243    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  100 
 
 		 955 aa  1961    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  94.8 
 
 		 963 aa  1846    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  50.5 
 
 		 938 aa  916    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  79.31 
 
 		 960 aa  1546    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  62.93 
 
 		 980 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  38.98 
 
 		 964 aa  631  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  29.53 
 
 		 924 aa  348  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  27.82 
 
 		 916 aa  317  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  27.82 
 
 		 916 aa  317  6e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  58.08 
 
 		 240 aa  297  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  23.91 
 
 		 874 aa  81.6  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.75 
 
 		 815 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  21.94 
 
 		 847 aa  69.7  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.32 
 
 		 868 aa  67.4  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.24 
 
 		 864 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  23 
 
 		 690 aa  60.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  22.12 
 
 		 864 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  23.4 
 
 		 841 aa  54.3  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.85 
 
 		 827 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  21.69 
 
 		 855 aa  50.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  27.49 
 
 		 569 aa  48.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  22 
 
 		 855 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  26.63 
 
 		 803 aa  47  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.69 
 
 		 866 aa  45.8  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.55 
 
 		 621 aa  45.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0016  hypothetical protein  23.37 
 
 		 938 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>