237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4758 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 373 aa  758    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  71.2 
 
 		 371 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  68.65 
 
 		 374 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  69.86 
 
 		 372 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  70.05 
 
 		 371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  66.22 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  67.03 
 
 		 374 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  67.03 
 
 		 374 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  66.94 
 
 		 374 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  68.39 
 
 		 373 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  68.39 
 
 		 386 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  65.11 
 
 		 368 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  64.29 
 
 		 365 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.43 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.89 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  59.07 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  51.65 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  54.42 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  50.82 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.81 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.18 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.41 
 
 		 373 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  45.6 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  45.33 
 
 		 378 aa  338  9e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.79 
 
 		 309 aa  332  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.44 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.11 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  46.38 
 
 		 373 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  46.11 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  46.61 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.06 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.41 
 
 		 376 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.16 
 
 		 371 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.28 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.78 
 
 		 369 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.01 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.01 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  43.16 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.01 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.23 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.82 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  40.27 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  43.35 
 
 		 376 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  40 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.22 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.38 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.4 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.97 
 
 		 368 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.77 
 
 		 376 aa  278  9e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.71 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  40.27 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.66 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.35 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.27 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.27 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.59 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.63 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  37 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.66 
 
 		 367 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  35.68 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.94 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  30.65 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.96 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.46 
 
 		 151 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  38.26 
 
 		 156 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25.69 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25.41 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.18 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.94 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3993  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.92 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.284344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.38 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.31 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  34.16 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.85 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.73 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.99 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  28 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  28.36 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  22.56 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.14 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  24.54 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.46 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.15 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.12 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.18 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.14 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.64 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  22.8 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.13 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  29.21 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  22.48 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  29.84 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  25.16 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.89 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.73 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.49 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>