More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1911 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248685  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  56.9 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2926  hypothetical protein  55.7 
 
 		 323 aa  342  8e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.3 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.55 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.55 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.8 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.33 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.47 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.63 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  41.25 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.26 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.67 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.24 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.51 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  41.04 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  39.52 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  40.55 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  40.31 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.34 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  39.08 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.34 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  38.74 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.38 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.75 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.8 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.22 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.31 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.31 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.58 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.07 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.93 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.98 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.92 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  39.69 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.47 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  37.85 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  39.73 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.86 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  40.25 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.78 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.08 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.89 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.7 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  39.93 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.6 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  37.35 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  36.28 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.96 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  38.73 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.36 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.81 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.44 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  38.44 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.19 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  41.03 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  41.39 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.13 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.53 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.3 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.53 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.61 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.46 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.53 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  41.49 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  36.73 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  37.73 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.15 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  40.13 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.36 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 		 332 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.31 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  39.38 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.04 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  34.8 
 
 		 329 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  37.1 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  40.13 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  36.81 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  38.32 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.93 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.87 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.89 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.2 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  35.87 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.66 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  39.67 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>