More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1519 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  859    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  82.23 
 
 		 448 aa  693    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  71.46 
 
 		 442 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  69.03 
 
 		 437 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  66.35 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  60.66 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  60.9 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  52.37 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  51.3 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  52.01 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  50.93 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  51.28 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  51.76 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  50 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  50 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  51.67 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  49.77 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  49.88 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  50.12 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  50.7 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  49.41 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  46.7 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  52.22 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  49.41 
 
 		 443 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  46.1 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  48.83 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  40.47 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  41.45 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  38.42 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  42.69 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  37.86 
 
 		 447 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  39.53 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  38.37 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  41.08 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  39.25 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  41.77 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  38.06 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  38.06 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 		 432 aa  272  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  40.96 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  40.28 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  39.39 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  39.39 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  36.53 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  37.79 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  38.26 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  40.42 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  38.08 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  37.79 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  36.45 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  37.97 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  37.68 
 
 		 446 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  37.35 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.34 
 
 		 465 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  34.43 
 
 		 407 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  38.33 
 
 		 424 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  36.88 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  35.73 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  35.92 
 
 		 431 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  38.55 
 
 		 429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  39.72 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  35.22 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  33.65 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  34.35 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  37.77 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  36.93 
 
 		 466 aa  243  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  36.88 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  36.77 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  35.68 
 
 		 447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  34.52 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  34.19 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  36.9 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.76 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  36.34 
 
 		 452 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  35.98 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  36.56 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  34.11 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  34.98 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  32.24 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  33.33 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  30.88 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.64 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  31.85 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  31.12 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  31.12 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  37.91 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  30.14 
 
 		 447 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  30.14 
 
 		 447 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  30.14 
 
 		 447 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  30.14 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  30.14 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  30.14 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  30.14 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  30.14 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  30.14 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  35.36 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  30.64 
 
 		 447 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  30.64 
 
 		 447 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>