286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0728 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 202 aa  386  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  65.79 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  63.1 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  61.45 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  52.43 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  43.98 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  51.38 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  49.45 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  46.96 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  46.45 
 
 		 232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  44.2 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  42.69 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  48.62 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  42.49 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  42.49 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  37.29 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  42.46 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  40.11 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  31.33 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  31.36 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.18 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  28.9 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  29.63 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  26.86 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  29.29 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.03 
 
 		 832 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  29.95 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  28.65 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  31.41 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  31.41 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  31.41 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  31.48 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  29.1 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  31.85 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  31.88 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  32.31 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  29 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  29.11 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  30.19 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  31.85 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  31.85 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  31.1 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  32.31 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  36.88 
 
 		 798 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.87 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  31.49 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  31.65 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  30.41 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  32.02 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  29.47 
 
 		 743 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  28.88 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.01 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2644  cytochrome c oxidase subunit III  26.29 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.252638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  27.13 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  30.38 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  26.6 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  30 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4044  cytochrome c oxidase, subunit III  24.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3989  cytochrome c oxidase, subunit III  24.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3702  cytochrome c oxidase, subunit III  24.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1195  cytochrome c oxidase, subunit III  24.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  27.33 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4060  cytochrome c oxidase, subunit III  24.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  31.01 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3768  cytochrome c oxidase subunit III  24.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3854  cytochrome c oxidase subunit III  25 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3685  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4152  cytochrome c oxidase subunit III  25 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.951057  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  25.26 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3957  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  33.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.45 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  28.85 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.09 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  33.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  31.49 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  27.8 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.61 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  36.56 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.27 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  33.58 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.88 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  28.31 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  28.18 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  31.09 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  37.7 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  30.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  27.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.77 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  27.43 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  28.18 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  31.06 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0543  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.4 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  26.47 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0499  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  26.4 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.51952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  28.29 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  30.67 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  30.51 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  32.54 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>