242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5605 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 357 aa  738    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  59.48 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  59.48 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  59.48 
 
 		 274 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  59.48 
 
 		 274 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  59.83 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  59.39 
 
 		 378 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  59.39 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  57.33 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  48.26 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  51.95 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  48.39 
 
 		 263 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  48.66 
 
 		 278 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  48.39 
 
 		 263 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  48.66 
 
 		 256 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  46.05 
 
 		 262 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  44.02 
 
 		 274 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  49.79 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  42.49 
 
 		 273 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  40.29 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  49.35 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  50.65 
 
 		 554 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  50.22 
 
 		 617 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  50.22 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  49.78 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  31.31 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 348 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  26.27 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1889  hypothetical protein  54.13 
 
 		 156 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0556578  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.33 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 348 aa  92.8  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.81 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 		 628 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  26.8 
 
 		 665 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  23.77 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 510 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 274 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 279 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 278 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  22.57 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  22.57 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  28.37 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  27.24 
 
 		 624 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  21.5 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.91 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  22.83 
 
 		 673 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  22.83 
 
 		 673 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  22.83 
 
 		 673 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  24.67 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  27.91 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  25.34 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.52 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  24.42 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  25.19 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  25.19 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 672 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.13 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 645 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  25.19 
 
 		 671 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  27.52 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  27.52 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>