95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2667 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  76.42 
 
 		 212 aa  328  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  72.77 
 
 		 208 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  72.55 
 
 		 210 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  74.02 
 
 		 210 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  72.82 
 
 		 210 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  72.82 
 
 		 210 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  72.14 
 
 		 210 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  70.53 
 
 		 210 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  63.98 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  69.11 
 
 		 374 aa  274  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  68.59 
 
 		 366 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  68.59 
 
 		 378 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  68.59 
 
 		 366 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  69.54 
 
 		 201 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  68.59 
 
 		 378 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  68.59 
 
 		 361 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  68.06 
 
 		 373 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  65.46 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  69.5 
 
 		 217 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  64.39 
 
 		 336 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  66.67 
 
 		 203 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  66.34 
 
 		 212 aa  254  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  65.99 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  65.82 
 
 		 224 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  65.22 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  65.82 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  69.27 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  57.84 
 
 		 209 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  60.98 
 
 		 223 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  64.97 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  58.05 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  56.63 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  55.22 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  52.55 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  53.55 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  53.92 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  55.29 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  54.31 
 
 		 201 aa  191  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  56.78 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  56.78 
 
 		 211 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  53.27 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  49.73 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  53.33 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  54.02 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  48.24 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  53.76 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  49.25 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  54.82 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  54.22 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  40 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  41.4 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  37.56 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  39.42 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  32.45 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  35.38 
 
 		 242 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  35.56 
 
 		 242 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  29.69 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  30.81 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  36.93 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  28.74 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  38.14 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  26.88 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  30.94 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  35.62 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  35.62 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  29.08 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  30.82 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.02 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.79 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.74 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  29.89 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.34 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  25.69 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  33.15 
 
 		 280 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.71 
 
 		 495 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  30.06 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  26.37 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  29.11 
 
 		 544 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  27.98 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0855  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.32 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.34705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.93 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  28.23 
 
 		 366 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  25.87 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  25.65 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  24.55 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.4 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  23.56 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  26.58 
 
 		 566 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.48 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  25.95 
 
 		 571 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  26.58 
 
 		 566 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1901  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  27.51 
 
 		 227 aa  41.6  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>