59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2148 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
243 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  93 
 
 
251 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  53.19 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  57.5 
 
 
251 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  56.82 
 
 
248 aa  238  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  55.88 
 
 
249 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  58.58 
 
 
250 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  57.4 
 
 
250 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  57.85 
 
 
250 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  55.8 
 
 
250 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  59.45 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  53.85 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  53.42 
 
 
254 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  52.17 
 
 
249 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  52.17 
 
 
249 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  52.17 
 
 
249 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  49.78 
 
 
230 aa  215  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  55.56 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  47.62 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  51.74 
 
 
267 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  55.56 
 
 
254 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  53.85 
 
 
258 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  48.72 
 
 
241 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  43.93 
 
 
261 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  49.78 
 
 
241 aa  201  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  51.74 
 
 
267 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  42.68 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  43.1 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  50.87 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  50.87 
 
 
267 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  43.93 
 
 
244 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  50.21 
 
 
270 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.02 
 
 
250 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  51.11 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  43.78 
 
 
259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  56.19 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  48.02 
 
 
258 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  48.31 
 
 
278 aa  168  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  46.06 
 
 
258 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  47.69 
 
 
252 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  49.72 
 
 
194 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  45.61 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  45.09 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  30.8 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  41.46 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  29.18 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  64 
 
 
61 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  59.65 
 
 
83 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.33 
 
 
309 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  23.66 
 
 
282 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  32.14 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  20.08 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  24.12 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  28.05 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  31.19 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  21.07 
 
 
260 aa  41.6  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>