More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4201 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  65.03 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  62.78 
 
 		 311 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  61.81 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  63.46 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  60.26 
 
 		 322 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  60.52 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 317 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.29 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  58.65 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  59.87 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  56.83 
 
 		 319 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 319 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  57.83 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 316 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  54.34 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  53.67 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 339 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  50.16 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  53.21 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  53.21 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  48.06 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  46.77 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  48.22 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  44.95 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.45 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  45.25 
 
 		 327 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  43.95 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  41.23 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  40.84 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  41.8 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  41.83 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  43.69 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.69 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  43.69 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  42.05 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  39.87 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  45.42 
 
 		 320 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>