More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1796 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
387 aa  798    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  73.81 
 
 
406 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  81.33 
 
 
377 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  77 
 
 
353 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  76.36 
 
 
353 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  76.18 
 
 
353 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  77 
 
 
352 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  76.36 
 
 
387 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  76.68 
 
 
352 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  76.36 
 
 
353 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  73.16 
 
 
344 aa  504  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  71.92 
 
 
348 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  74.04 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  73.1 
 
 
342 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  73.87 
 
 
877 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  69.3 
 
 
348 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  73.87 
 
 
404 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  73.87 
 
 
441 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  73.87 
 
 
439 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  73.87 
 
 
404 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  71.99 
 
 
355 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  70.55 
 
 
339 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  64.35 
 
 
341 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  63.81 
 
 
333 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  64.61 
 
 
332 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  63.81 
 
 
333 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  65.91 
 
 
341 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  64.61 
 
 
332 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  65.26 
 
 
335 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  61.04 
 
 
350 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  62.01 
 
 
332 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  61.04 
 
 
332 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  61.36 
 
 
332 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  61.69 
 
 
332 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  60.32 
 
 
331 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  58.15 
 
 
331 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  58.17 
 
 
344 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  57.19 
 
 
345 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  57.52 
 
 
344 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  52.13 
 
 
333 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  52.6 
 
 
381 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  54.13 
 
 
368 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  49.34 
 
 
333 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  48.99 
 
 
330 aa  318  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  47.1 
 
 
331 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  44.37 
 
 
329 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
346 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  39.28 
 
 
345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  44.08 
 
 
336 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
336 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  39.53 
 
 
334 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
340 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 
340 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
262 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
265 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 
291 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.06 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  28.06 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28.06 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  28.06 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  28.06 
 
 
291 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  28.06 
 
 
291 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.55 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  41 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  37.29 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.03 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
287 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.09 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
278 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
278 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.41 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>