More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1698 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  78.7 
 
 
408 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  78.7 
 
 
408 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  78.7 
 
 
406 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  78.64 
 
 
406 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  78.7 
 
 
408 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  79.15 
 
 
420 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  78.7 
 
 
408 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  78 
 
 
408 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  87.44 
 
 
406 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  78.7 
 
 
408 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  819    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  78.64 
 
 
406 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  78.7 
 
 
408 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  78.96 
 
 
406 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  78.71 
 
 
406 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  77.48 
 
 
406 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  78.64 
 
 
406 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  87.19 
 
 
406 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  60.9 
 
 
416 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  60.65 
 
 
416 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  54.57 
 
 
417 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  54.57 
 
 
417 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  54.57 
 
 
417 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  54.57 
 
 
417 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  54.57 
 
 
417 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  56.78 
 
 
410 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  55.76 
 
 
403 aa  428  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  45.18 
 
 
407 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  48.28 
 
 
422 aa  352  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 
430 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  39.39 
 
 
542 aa  280  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  35.89 
 
 
493 aa  266  4e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  37.85 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  38.46 
 
 
514 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  38.51 
 
 
547 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  36.06 
 
 
431 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  31.38 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 
411 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  31.64 
 
 
409 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  32.07 
 
 
409 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.29 
 
 
405 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.29 
 
 
405 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.29 
 
 
405 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  31.55 
 
 
425 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  31.73 
 
 
425 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  29.89 
 
 
426 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  28.64 
 
 
409 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  29.62 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  29.62 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  28.6 
 
 
510 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  28.38 
 
 
510 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  28.38 
 
 
510 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  27.91 
 
 
429 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.95 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  29.25 
 
 
418 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  27.2 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.46 
 
 
429 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  26.54 
 
 
496 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  32.32 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  29.16 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.36 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  26.32 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  26.32 
 
 
496 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  26.32 
 
 
496 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  26.32 
 
 
496 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.44 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  31.29 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.72 
 
 
423 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  26.82 
 
 
424 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  27.71 
 
 
428 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  26.54 
 
 
424 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  26.82 
 
 
424 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  32.4 
 
 
402 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  28.82 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  26.17 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  26.34 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  29.38 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  28.76 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  25.66 
 
 
496 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  25.66 
 
 
496 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  27.36 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  28.31 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  25.44 
 
 
496 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.71 
 
 
437 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.46 
 
 
434 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.82 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  26.54 
 
 
496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  28.14 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  29.55 
 
 
491 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  25.44 
 
 
496 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  25.44 
 
 
496 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  25.44 
 
 
496 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  25.44 
 
 
496 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  25.44 
 
 
496 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  28.14 
 
 
415 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.76 
 
 
435 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.84 
 
 
420 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>