156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1544 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  72 
 
 		 287 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  72.76 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  67.77 
 
 		 282 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  62.55 
 
 		 271 aa  324  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  59.22 
 
 		 271 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  59.07 
 
 		 272 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  55.16 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  55.26 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  57.14 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  56.63 
 
 		 267 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  55.08 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  49.21 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  49.4 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  48.4 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  48.21 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  47.81 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  45.15 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  45.99 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  39.69 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  49.1 
 
 		 176 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  37.34 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 270 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 270 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  36.55 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  36.55 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  33.05 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.22 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.89 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.19 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  21.37 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  44.19 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.91 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 		 353 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  23.39 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  23.05 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0775  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.841147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  21.13 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  20.3 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  27.76 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.57 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  32.31 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  22.04 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  20.33 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  21.86 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>