More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6078 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  82.61 
 
 
430 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  82.61 
 
 
430 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  82.61 
 
 
430 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  90.77 
 
 
390 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  91.79 
 
 
390 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  90.77 
 
 
390 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  100 
 
 
390 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  90.77 
 
 
390 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  90.51 
 
 
390 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  89.74 
 
 
390 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  82.35 
 
 
390 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  82.35 
 
 
430 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  82.35 
 
 
430 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  82.35 
 
 
430 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  59.85 
 
 
387 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  58.99 
 
 
394 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  56.78 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  58.06 
 
 
386 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  56.78 
 
 
386 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  56.78 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  56.52 
 
 
386 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  58.36 
 
 
411 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  58.36 
 
 
384 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  58.36 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  58.36 
 
 
384 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  58.27 
 
 
385 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  57.99 
 
 
385 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  56.52 
 
 
386 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  58.54 
 
 
385 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  58.36 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  58.36 
 
 
384 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  58.36 
 
 
384 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  53.83 
 
 
389 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  54.87 
 
 
386 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  55.19 
 
 
393 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  56.87 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  57.1 
 
 
388 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  55.19 
 
 
386 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  56 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  57.45 
 
 
385 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  57.45 
 
 
385 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  57.18 
 
 
385 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  53.83 
 
 
376 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  53.83 
 
 
376 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  52.76 
 
 
390 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  53.57 
 
 
376 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  52.6 
 
 
404 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  50.13 
 
 
386 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  53.64 
 
 
376 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  52.45 
 
 
386 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  50.37 
 
 
399 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  50.37 
 
 
399 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  50.37 
 
 
399 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  50.37 
 
 
399 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  50.12 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  50.64 
 
 
391 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  51.47 
 
 
386 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  49.74 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  50.95 
 
 
386 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  50.95 
 
 
386 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  49 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  49.74 
 
 
436 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  49.5 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  49.5 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  50 
 
 
436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  49.5 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  49.5 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  49.5 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  49.25 
 
 
386 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  46.58 
 
 
397 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.63 
 
 
385 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.63 
 
 
385 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  45.52 
 
 
421 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  46.95 
 
 
445 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  46.82 
 
 
397 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  45.52 
 
 
421 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  45.8 
 
 
397 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  46.95 
 
 
397 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  45.8 
 
 
397 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  47.24 
 
 
383 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.73 
 
 
383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.74 
 
 
383 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.74 
 
 
383 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  47.51 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  46.86 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.23 
 
 
391 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  48.21 
 
 
402 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  43.38 
 
 
394 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  43.75 
 
 
395 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  43.75 
 
 
395 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.58 
 
 
389 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  44.54 
 
 
381 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  44.66 
 
 
398 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.66 
 
 
395 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  44.83 
 
 
384 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  43.23 
 
 
395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  44.38 
 
 
398 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  43.39 
 
 
380 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  43.84 
 
 
383 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  43.87 
 
 
386 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>