More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5582 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2779  cold-shock DNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.886497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  53.7 
 
 		 1544 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  52.63 
 
 		 1626 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  52.17 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  39.08 
 
 		 1104 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  46.38 
 
 		 631 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  42.67 
 
 		 603 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1145 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  42.47 
 
 		 610 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0200  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0333811  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0928  cold-shock DNA-binding domain protein  46.77 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  43.75 
 
 		 67 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 66 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 65 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  50 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 		 66 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 66 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  48.39 
 
 		 65 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0970  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0527  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 63 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4749  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000498779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.16 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0754  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.47 
 
 		 648 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10888  cold shock protein B cspB  32.98 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73128e-16  normal  0.272066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  47.54 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  46.77 
 
 		 67 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.62 
 
 		 69 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.68 
 
 		 69 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3013  cold-shock DNA-binding domain protein  43.55 
 
 		 65 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000213425  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 69 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2290  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 68 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.388252  hitchhiker  0.00970612 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.9 
 
 		 66 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 66 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 65 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  46.77 
 
 		 67 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  45.9 
 
 		 77 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  46.77 
 
 		 65 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  45.9 
 
 		 66 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 65 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  46.77 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 65 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  46.77 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  46.77 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  46.77 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  45.9 
 
 		 66 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  46.77 
 
 		 65 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.77 
 
 		 65 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 66 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 66 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.55 
 
 		 66 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  46.77 
 
 		 65 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 67 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  44.78 
 
 		 68 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  45.16 
 
 		 65 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 69 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 67 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 67 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2592  cold-shock DNA-binding domain protein  49.15 
 
 		 64 aa  52.4  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00103043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 65 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.54 
 
 		 66 aa  52  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0985  cold-shock domain-contain protein  40.62 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.693181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 66 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 68 aa  52  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  40.62 
 
 		 66 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  42.19 
 
 		 69 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  44.26 
 
 		 66 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1523  cold shock protein  39.06 
 
 		 69 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00439829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 66 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2878  hypothetical protein  41.54 
 
 		 68 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2740  hypothetical protein  41.54 
 
 		 68 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 68 aa  52  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  42.62 
 
 		 66 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 69 aa  51.6  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 		 68 aa  51.6  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 65 aa  51.6  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  44.26 
 
 		 66 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  45.9 
 
 		 66 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 66 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>