54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0935 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  220  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  88.79 
 
 		 107 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  90.11 
 
 		 91 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 115 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  65.98 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  47 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  30.68 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  33.72 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  33.8 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  34.52 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  31.82 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  35.82 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  35.82 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  27.37 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  37.1 
 
 		 91 aa  43.5  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  30.12 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  35.21 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0795  hypothetical protein  30.14 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1137  hypothetical protein  37.04 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0281  hypothetical protein  27.4 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>