251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2840 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2840  chromosome segregation and condensation protein ScpB  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3788  chromosome segregation and condensation protein ScpB  72.85 
 
 		 221 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4550  putative transcriptional regulator  57.69 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4583  putative transcriptional regulator  53.68 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4574  putative transcriptional regulator  53.51 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4197  condensin subunit ScpB  52.11 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323674  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  48.65 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7277  hypothetical protein  56.42 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4800  putative transcriptional regulator  54.84 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8008  hypothetical protein  51.56 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915827  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4509  putative transcriptional regulator  48.4 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.831717  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4029  chromosome segregation and condensation protein ScpB  49.05 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3753  chromosome segregation and condensation protein ScpB  49.05 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352039  normal  0.566096 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4232  hypothetical protein  51.09 
 
 		 197 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3402  putative transcriptional regulator  46.49 
 
 		 196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0776378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9010  hypothetical protein  52.21 
 
 		 149 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  36.7 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  36.97 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  38.1 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  37.27 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  33.53 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  33.53 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  37.27 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  34.46 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  32.2 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  30.49 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  33.95 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  38.51 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  29.01 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  39.51 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  36.84 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  35.47 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  31.28 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  32.1 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  30.67 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.45 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.48 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  30.54 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  33.52 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.98 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  32.1 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  32.26 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  30.06 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  31.9 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.54 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  31.48 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.81 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  31.9 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  31.9 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  31.29 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  31.9 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  31.48 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  31.68 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  31.68 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.45 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  34.46 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  32.3 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  30.86 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.48 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  29.28 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  32.12 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.94 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.57 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.38 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>