More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1759 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  699    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.6 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 370 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  37.16 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  33.13 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  28.44 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  29.72 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  28.66 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  29.45 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 347 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 382 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  29.13 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  29.6 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  29.1 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.4 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.21 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  28.38 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>